LA HISTORIA DEL JAGUAR
Asociación Deportiva Isidro Metapán se fundó en el año 2,000, tras la fución de Isidro Menendez y Metapán F.C. dado qué, Metapán F.C. logró el ascenso a la Liga Mayor «A».
ASOCIACIÓN DEPORTIVA ISIDRO METAPÁN – CAMPEÓN 2007
Isidro Metapán terminó la fase regular de clasificación en segundo lugar con 29 puntos, detrás de Luis Ángel Firpo, que se clasificó a los play off con 33 puntos.
El equipo jaguar, jugó las semifinales contra el 11 Municipal, campeón defensor del título, perdiendo el primer partido en Ahuachapán 2-1; pero en el Calero Suarez exhibió su potencial, ganando la vuelta 4-1.
En la final, Firpo llegaba a pelear el título, habiendo eliminado a C.D. Águila, llegaba como favorito habiendo clasificado en primer lugar y después de un partido parejo, que llegó hasta los tiempos extras, cuando todo parecía que iba a definirse en la tanda de penaltis, Fabinho definío el partido al minuto 119, dándole a Isidro Metapán su primera corona en el Fútbol Nacional.
Bicampeonato temporada 2008-09
A.D. ISIDRO METAPÁN VS C.D. CHALATENANGO
El día Domingo 21 de diciembre de 2008, Chalatenago e Isidro Metapán disputaron la final de la Primera División, ganando así nuestro segundo campeonato.
Nuestra segunda corona
Llegamos a ese partido con las ganas de hacer historia, después de haber finalizado la fase general de clasificación, Isidro Metapán consigue clasificar a semifinales como segundo lugar, fase en la que se tuvo que enfrentar a C.D. FAS.
En el primer juego en el Calero, FAS supera con marcador de 3 – 1 a Isidro Metapán, por lo que parecía imposible la remontada, llegamos al Quiteño con las ganas y la ilusión de seguir escribiendo nuestra historia, Williams Reyes al minuto 16´ empezó a construir la remontada, el trabajo ejecutado por nuestro equipo, el desempeño y buen juego hizo que al minuto 35´ José Amaya del Cid anotara el segundo y al minuto 45´ Dagoberto Portillo anotó el tercero de penal.
En la otra llave C.D. Chlatenango venció a Águila por un global de 3-1.
En la final, después de un empate 3 – 3, vencimos a A.D. Chalatenango en los penaltis. 
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